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members:aguilloux:enseignements:survivalanalysis [2019/10/22 09:58]
Agathe Guilloux [Longitudinal and survival data analysis (M2DSSAF et ENSIIE)]
members:aguilloux:enseignements:survivalanalysis [2019/10/22 10:00] (current)
Agathe Guilloux
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   * {{:​members:​aguilloux:​enseignements:​m2ds_surv:​lab4_project.pdf| Enoncé}}   * {{:​members:​aguilloux:​enseignements:​m2ds_surv:​lab4_project.pdf| Enoncé}}
   * [[https://​docs.google.com/​forms/​d/​1ciOUQoNZk9h4hcm0eZLm-ykjFHGNhkJNc2mPuaUSd54/​edit?​usp=sharing|Questionnaire google pour déclarer les équipes et uploader votre rapport]]   * [[https://​docs.google.com/​forms/​d/​1ciOUQoNZk9h4hcm0eZLm-ykjFHGNhkJNc2mPuaUSd54/​edit?​usp=sharing|Questionnaire google pour déclarer les équipes et uploader votre rapport]]
 +  * {{:​members:​aguilloux:​enseignements:​m2ds_surv:​import_data.zip|Code pour l'​import des données (d'​autres solutions sont possibles)}}
  
  
-wpbc = read_delim("​./​wpbc.data.txt",​delim=",",​col_names=F,​na = '?'​) 
  
-names_cov = paste0(rep(c('​radius','​texture','​perimeter','​area','​smoothness','​compactness',​ 
-                         '​concavity','​concave points','​symmetry','​fractal dimension'​),​3),​ 
-                   ​c(rep('​_mean',​10),​rep('​_SD',​10),​rep('​_worst',​10))) 
- 
-names(wpbc) = c('​id','​recurrent','​time',​names_cov,​c('​Tumor size','​Lymph node status'​)) 
- 
-wpbc = wpbc %>% mutate(id = factor(id)) %>​% ​ 
-                mutate( recurrent = recode_factor(recurrent , "​N"​ = FALSE, '​R'​ = TRUE ))  
-glimpse(wpbc) 
    
members/aguilloux/enseignements/survivalanalysis.txt · Last modified: 2019/10/22 10:00 by Agathe Guilloux

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