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Marie Luce Taupin
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Marie Luce Taupin
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 ====== Marie-Luce Taupin ======
 <WRAP group>
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-===== Actual position =====
+===== Position actuelle =====
+** Professeure Première classe à l'Université d'Evry.\\
-**Since 2009, I am a full professor at the university of Evry**, member of the team "Statistics and Genome" in the lab [[:welcome|LaMME]].
+** Depuis septembre 2023, je suis co-responsable avec Christophe Ambroise du Master 2, Data Science: santé, Assurance, Finance.
+([[http://www.math-evry.cnrs.fr/departement/doku.php?id=formation:master:m2ds]], Evry) \\
+ [[https://www.universite-paris-saclay.fr/formation/master/mathematiques-et-applications/m2-data-science-sante-assurance-et-finance | Master 2 Data Science Santé, Assurance, Finance]] à University Paris Saclay.\\
-**Since 2013, I am the director of the mathematics department of the University of Evry.\\
-**Since September 2018, I am responsible of the first year of Master Mathematics and Interactions ([[http://www.math-evry.cnrs.fr/departement/doku.php?id=formation:master:m1mint| M1 MINT]], Evry)
-in [[ https://www.universite-paris-saclay.fr/fr/formation/master/mathematiques-et-applications#mention |  the Master of Mathematics and Applications]] in University Paris Saclay.\\
-===== Research Interest =====
+===== Autres responsabilités collectives =====
-  * Semiparametric models
-  * Nonparametric estimation
-  * Survival analysis
+=== Depuis novembre 2023, membre du comité parité du LaMME. ===
-  * Dimension reduction / variable selection
-  * Model selection
-  * Mixture models
+=== Depuis novembre 2023, membre du comité développement durable du LaMME. ===
-  * Deconvolution
-  * Measurement errors models
-  * Sensitivity Analysis
+=== Depuis 2019 Membre du CNU 26 (membre nommé (suppléant) puis membre élu titulaire) ===
-  * Meta-modeling
-  * Statistics for genomics and genetics
+=== Depuis 2019, Membre du conseil d'UFR (UFR SFA) ===
+=== 2013-2021 Directrice du département de mathématiques d'EVRY. ===
+=== 2018-2023: Responsable du Master 1, Mathématiques et Interactions ===
+[[ https://www.math-evry.cnrs.fr/departement/doku.php?id=formation:master:m1mint | M1 MINT]] et [[ https://www.universite-paris-saclay.fr/fr/formation/master/mathematiques-et-applications#mention |  the Master of Mathematics and Applications]] de l'Université Paris Saclay.
+=== 2018-2022: Responsable de la mention de master (locale à Evry) de mathématiques ===
+=== 2016-2017 Participation au montage du M2 Data Science Santé, Assurance, finance, à la suite du M2 ISG, dont la création s'est faite sous ma responsabilité. ===
+=== Depuis 2016, membre du conseil de perfectionnement de la mention de Mathématiques et Applications de Paris Saclay.===
+=== 2016-2021: membre du conseil de perfectionnement de la licence de mathématiques d'Evry ===
+=== 2010-2014: membre élue du conseil d'UFR SFA ===
+=== Depuis 2015: membre élue du conseil du laboratoire du LaMME.===
+=== 2003-2006: directrice des études du DUT STID, année spéciale à l'IUT Paris Rives de Seine. ===
+=== 1998-2002: responsable des projets de 1ère année à l'IUT Paris Rives de Seine.===
+===== Autres =====
+=== Membres de comités de sélections (PR et MCF). ===
+=== 2008-2012: Titulaire de la PEDR. ===
+=== 2012-2015: accueil en délégation à l'unité MaiAGE de l'INRAE (Jouy-en-Josas)===
+=== Encadrements de stagiaires de master 1 et master 2.===
+=== 2006-2007: semestre de délégation CNRS au LMO (Orsay).===
+=== 2005: semestre CRCT au LMO (Orsay).===
+===== Thèmes de recherche =====
+  * Modèles semi-paramétriques
+  * Estimation non-paramétriqu
+  * Analyse de données de survie
+  * Réduction de dimension et sélection de variables
+  * Sélection de modèles
+  * Modèles de mélange
+  * Déconvolution
+  * Modèles avec erreurs
+  * Analyse de sensibilité
+  * Construction de méta-modèles
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 ===== PhD Students =====
 === Current ===
-     * Halala Kamari  started his thesis in september, 2016, under the supervision of  [[http://maiage.jouy.inra.fr/?q=fr/personnes-presentes|Sylvie Huet]], MaIAGE Unit in INRA, Jouy-En-Josas. She is working half time at our laboratory, spending the rest of the time in INRA. She is working on meta-modelling and sensitivity. She is receiving a 3-year financial support from the [[
+     * Odelia Guedj started this phd thesis in september 2020 under the supervision of [[ http://www.math-evry.cnrs.fr/members/aguilloux/welcome |Agathe Guilloux ]]. She is working on sensitivity analysis in linear and survival models. She is receiving a 3-year financial support from the the [[
 https://www.universite-paris-saclay.fr/fr/formation/doctorat/ecole-doctorale-de-mathematiques-hadamard-edmh#l-ecole-doctorale|EDMH]].
 === Past ===
+    * Halala Kamari  started his thesis in september, 2016, under the supervision of  [[http://maiage.jouy.inra.fr/?q=fr/personnes-presentes|Sylvie Huet]], MaIAGE Unit in INRA, Jouy-En-Josas. She is working half time at our laboratory, spending the rest of the time in INRA. She is working on meta-modelling and sensitivity. She is receiving a 3-year financial support from the [[
+https://www.universite-paris-saclay.fr/fr/formation/doctorat/ecole-doctorale-de-mathematiques-hadamard-edmh#l-ecole-doctorale|EDMH]]. She has presented his Phd defense on july 2020.
     * Marius Kwemou  started his thesis in July, 2010, under the supervision of  [[http://www.red.ird.fr/annuaire/membres_de_droit/le_hesran.htm|Jean-Yves Lehesran]], [[http://univi.net/ufrsat/lerstad/|Abdou Kâ Diongue]] from University Gaston Berger at Saint-Louis in Senegal and myself. He is working half time at our laboratory, spending the rest of the time in University Gaston Berger at Saint-Louis in Senegal. He is working on dimension reduction in logistic regression with an application to ACTU-PALU Data (ANR n°07-SEST-001). He is receiving a 3-year financial support from the [[http://www.ird.fr/|IRD]]. He has presented his Phd defense on september, the 29th, 2014.
     * Sarah Lemler  started her thesis in september, 2011, under the supervision of  [[http://www.lsta.upmc.fr/guilloux.php/ |Agathe Guilloux]] and myself. She is receiving a 3-year financial support from the french minister of Education and Research and Evry University. She is working on variable selection and dimension reduction in high-dimensional survival analysis. She has presented her Phd defense on december, the 9th, 2014.
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-===== Teachings  =====
-   * <color lightseagreen> L3 Sciences de la vie/ Sciences de la vie - Informatique "Cours MSV601 Modèle linéaire" </color>
-       * Cours {{:members:mtaupin:1718_msv601_cours_1.pdf| Transparents du cours}}
-       * Rappels de cours {{:members:mtaupin:1718_msv601_rappels.pdf| Transparents rappels}}
-   *  <color lightseagreen>  L2 Math Modélisation </color>
-      * Données "Recensement" {{:members:mtaupin:recensement.txt.pdf|Les Données}}
-      * Données "Evans" {{:members:mtaupin:Evans.txt.pdf|Les Données}}
-      * TP d'introduction {{:members:mtaupin:TP_intro.pdf|TP_intro}}
-      * Programme R "Recensement" {{:members:mtaupin:code-recensement.r.pdf|Code R}}
-      * Cours statistiques uni-dimensionnelles {{:members:mtaupin:l2_mode_lisation_statuni.pdf| Transparents}}
-      * Descriptif des données {{:members:mtaupin:recensement-description.pdf| Descriptif}}
-      * Cours de statistique bi-dimensionnelles {{:members:mtaupin:l2_modelisation_stat-bivarie.pdf| Transparents}}
-      * Cours  sur les couples {{:members:mtaupin:bivarie2cours.pdf|Transparents}}
-      * Cours sur la régression {{:members:mtaupin:regression.pdf|Transparents}}
-   * <color lightseagreen> M1 MINT  "Times Series" </color>
-       * Cours {{:members:mtaupin:2018-2019-ts-slides-cours.pdf| transparents }}
-       * Enoncés du TP1 {{|TP1}}
-   * <color lightseagreen> M2 Data Sciences: Santé, Assurance, Finance, Statistique non paramétrique </color>
-       * Cours {{:members:mtaupin:cours_stat_np_2018.pdf| Transparents}}
-       * Feuilles de TD-TP {{:members:mtaupin:statnp-tp1.pdf| TP1}}{{:members:mtaupin:tp2.pdf| TP2}}
-       * {{:members:mtaupin:alcool.rdata.pdf| Données alcool}}
-       * {{:members:mtaupin:hormone.rdata.pdf| Données hormones}}
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 [[https://sites.google.com/site/semstats/home | Séminaire Parisien de Statistique]]
-[[http://www.ssbgroup.fr/ | SSB Group]]
-[[http://http://www6.jouy.inra.fr/mia | Unité MIA-Jouy, INRA]]
 [[http://www.gdr-mascotnum.fr/ | GdR MASCOT-NUM]]
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 [[ http://data.princeton.edu/wws509/notes/ | Generalized Linear Models ]]
+===== Publications  =====
+  * P1 Clémence Frioux, Sylvie Huet, Simon Labarthe, Julien Martinelli, Thibault Malou, et al.. Accelerating metabolic models evaluation with statistical metamodels: application to Salmonella infection models. 2022. [[ https://hal.inrae.fr/hal-03635862v2 | https://hal.inrae.fr/hal-03635862v2 ]] ESAIM: PROCEEDINGS AND SURVEYS, September 2023, Vol. 73, p. 187-217
+  * P2 Kamari H, Huet S. et Taupin M.-L., "The Journal of Statistical Software: RKHSMetaMod: An R Package to Estimate the Hoeffding Decomposition of a Complex Model by Solving RKHS Ridge Group Sparse Optimization Problem", The R Journal, 2022 [[ https://arxiv.org/abs/1905.13695v6 | https://arxiv.org/abs/1905.13695v6 ]] et [[ https://hal.science/hal-02366422v1 | https://hal.science/hal-02366422v1 ]]
+  * P3 RKHSMetamod R package 2019 [[ https://CRAN.R-project.org/package=RKHSMetaMod | RKHSMetamod ]]
+  * P4 Ferrer Savall, J., Franqueville, D., Barbillon, P., Benhamou, C., Durand, P. , Taupin,M.-L., Monod, H. et Drouet, J.-L. Sensitivity analysis of spatio-temporal models describing nitrogen transfers, transformations and losses at the landscape scale. Environnemental Modelling & Softeware Vol 111:356-367(2019).
+  * P5 Huet, S. et Taupin, M.-L. Metamodel construction for sensitivity analysis. (2017). ESAIM: PROCEEDINGS AND SURVEYS, Vol. 60, p. 27-69. (2017) [[ https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01434895 | https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01434895 ]]
+  * P6 Ferrer Savall, J., Franqueville, D., Benhamou, C., Barbillon, P., Durand, P. , Taupin, M.-L., Monod, H. et Drouet, J.-L. Sensitivity analysis of spatio-temporal models describing nitrogen transfers, transformations and losses at the landscape scale. Proceedings of Spatial Accuracy (2016) https://arxiv.org/abs/1709.08608v1
+  * P7 Guilloux, A., Lemler, S. , Taupin, M.-L. Adaptive estimation of the baseline hazard function in the Cox model by model selection, with high-dimensional covariates. Journal of Statistical Planning and Inference, 171:38-62, Elsevier, (2016). [[ https://arxiv.org/abs/1503.00226v2 | https://arxiv.org/abs/1503.00226v2 ]]
+  * P8 Guilloux, A., Lemler, S., Taupin, M.-L. Adaptive kernel estimation of the baseline function in the Cox model with high-dimensional covariates. Journal of Multivariate Analysis, 148:141-159, Elsevier, (2016). [[ https://arxiv.org/abs/1507.01397v1| https://arxiv.org/abs/1507.01397v1 ]]
+  * P9 Dedecker J., Samson A. et Taupin M.-L.: Estimation in autoregressive model with measurement error. (2014) ESAIM P&S. [[ http://arxiv.org/abs/1105.1310  | http://arxiv.org/abs/1105.1310 ]]
+  * P10 Taupin, M.-L. Comment on : Identification and estimation of nonlinear models using two samples with nonclassical measurement errors. Journal of nonparametric statistics 22 (2010) pp 409-414.
+  * P11 Comte F., Dedecker J. et Taupin M.-L Adaptive density deconvolution with dependent inputs. Math. Methods Statist., 17 (2008), pp87-112. [[ http://www.springerlink.com/content/22584x673251m076/ | http://www.springerlink.com/content/22584x673251m076/ ]]
+  * P12 Martin-Magniette M.-L. et Taupin M.-L. Semi-parametric estimation of the hazard function in a model with covariate measurement error. ESAIM Probab&Stat. 13 (2009), pp87-114 [[ http://fr.arxiv.org/abs/math.ST/0606192 |  http://fr.arxiv.org/abs/math.ST/0606192 ]]
+  * P13 Comte F., Dedecker J. et Taupin M.-L Adaptive density estimation for general ARCH models. Econometric Theory 24(6) 2008, pp. 1628-1662. [[http://journals.cambridge.org/action/displayJournal?jid=ECT. | http://journals.cambridge.org/action/displayJournal?jid=ECT. ]]
+  * P14 Butucea C. et Taupin M.-L. New M-estimators in semiparametric regression with errors-in- variables.Annales de l’Institut Henri Poincaré - Probabilités et Statistique 44 (2008) no.3, pp. 393–421. [[http://fr.arxiv.org/abs/math.ST/0511105 | http://fr.arxiv.org/abs/math.ST/0511105 ]]
+  * P15 Comte F. et Taupin M.-L. Nonparametric estimation of the regression function in an errors-in-variables model. Statistica Sinica 17 (2007), 1065-1090. [[ http://fr.arxiv.org/abs/math.ST/0511111 |  http://fr.arxiv.org/abs/math.ST/0511111 ]]
+  * P16 Comte F., Rozenholc Y. et Taupin M. L. Finite sample penalization in adaptive density deconvolution. Journal of Statistical Computation and Simulation, 77 (2007), Issue 11, pp. 977-1000. [[ http://fr.arxiv.org/abs/math.ST/0601098 | http://fr.arxiv.org/abs/math.ST/0601098 ]]
+  * P17 Comte F., Rozenholc Y. et Taupin M.-L. Penalized contrast estimator for adaptive density deconvolution. The Canadian Journal of Statistics 34 (2006), No 3, pp. 431-452. [[ http://fr.arxiv.org/abs/math.ST/0601091 | http://fr.arxiv.org/abs/math.ST/0601091]]
+  * P18 Matias, C. Taupin, M.-L. Minimax estimation of linear functionals in the convolution model. Math. Methods Statist. 13 (2004), no. 3, pp. 282–328.
+  * P19 Comte, F. Taupin, M.-L. Semiparametric estimation in the (auto)-regressive  -mixing model with errors-in-variables. Math. Methods Statist. 10 (2001), no. 2, pp. 121–160.
+  * P20 Taupin, M.-L. Semi-parametric estimation in the nonlinear structural errors-in-variables model. Ann. Statist. 29 (2001), no. 1,66–93
+===== Posters =====
+  *  Frioux, Clémence and Huet, Sylvie and Labarthe, Simon and Martinelli, Julien and Malou, Thibault and Sherman, David James and Taupin, Marie-Luce and Salas, Pablo Ugalde, Poster . //Dynamic Flux Balance Analysis with Metamodels// JOBIM 2022 (Société Française de BioInoformatique) [[ https://hal.science/hal-04236775 | https://hal.science/hal-04236775 ]],
+  * Frioux, Clémence and Huet, Sylvie and Labarthe, Simon and Martinelli, Julien and Malou, Thibault and Sherman, David James and Taupin, Marie-Luce and Ugalde-Salas, Pablo, Poster . //Dynamic Flux Balance Analysis with Metamodels// Microbial communities: current approaches and open challenges 2022 [[ https://hal.science/hal-04252041 | https://hal.science/hal-04252041 ]]
+===== Articles soumis, en révision, en cours de rédaction =====
+  * S1 Huet, S., Kamari, H. et Taupin, M.-L. Metamodel construction for sensitivity analysis in the context of dependent input and sub-gaussian noise. En cours de rédaction
+  * S2 Kwemou, M. et Taupin, M.-L. et Tocquet, A.-S. Model selection in Logistic regression. (2014). En révision https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01188376
+  * S3 Kwemou, M. et Taupin, M.-L. et Dos Santos, S. et Le Hesran, J.-Y. Variables Selection strategies in large socio-epidemiological surveys. Identification of households at risk of having febrile episode in Dakar, Sénégal. (2014) Unpublished.
+===== Thèse et HDR  =====
+  * 2008 Habilitation à Diriger des Recherches, soutenue le 09 décembre 2008 à l’Université Paris Descartes. //Déconvolution et Estimation dans les modèles avec erreurs sur les variables.// {{:members:mtaupin:habilitation.pdf| Habilitation }}
+  * 1994-1998 Thèse de Doctorat de l’Université Paris-Sud. effectuée au Laboratoire de Biométrie, INRA (Jouy-en-Josas) sous la direction de Sylvie Huet (INRA) et P. Massart (Univ. Paris-Sud). //Estimation semi-paramétrique pour le modèle de régression non linéaire avec erreurs sur les
+variables//.[[https://www.theses.fr/1998PA112004]]| Thèse
-<btex>auth:taupin</btex>

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