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Christophe Ambroise [Séminaires]
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 ====== Équipe statistique et génome ======
-Cette équipe du LaMME consituait le laboratoire Statistique et Génome avant le 1er janvier 2014.
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 ===== Thématiques de recherche =====
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 Notre but est de développer des méthodes originales pour l’analyse de données biologiques, issues majoritairement de la biologie moléculaire.
-Plus précisément, les progrès immenses de la technologie inondent les banques de données d’une information très riche et très variée, que la communauté scientifique n’est même plus à même d’exploiter raisonnablement. Un exemple illustre les changements d’échelle dans l’obtention des données : le Projet Génome Humain – auquel participait la Génopole d’Évry –, lancé en 1990, a mis 14 ans pour obtenir une séquence “complète” de ce génome. Les techniques modernes permettent de séquencer le génome d’un individu en... deux jours !
+Les avancées technologiques considérables génèrent aujourd'hui une quantité colossale de données riches et variées, que la communauté scientifique peine à exploiter pleinement. Un exemple frappant illustre l'évolution des échelles dans la production de données : le Projet Génome Humain, initié en 1990 avec la participation de la Génopole d'Évry, a nécessité 14 ans pour séquencer le génome humain de manière 'complète'. Aujourd'hui, les technologies de séquençage permettent d'obtenir le génome d'un individu en à peine 24 heures !
 Par ailleurs ces données se diversifient : à côté des séquences chromosomiques on dispose de séquences protéiques, d’informations de plus en plus précises sur leurs conformations dans l’espace ; mais aussi de “données d’expression” relatant quels gènes sont actifs dans les différentes conditions d’existence, donc quelles protéines sont présentes – voire en quelle quantité ; on a aussi compris que les gènes-à-protéines ne sont pas les seuls et que d’autres produisent toutes sortes d’ARN (les ARN messagers, ribosomiques, de transfert, les “small”-ARN, ...), dont la présence ou la quantité sont mesurées ; on est capable de mesurer directement certaines interactions entre protéines (CHIP-chips, par exemple) ou entre diverses molécules ; ajoutons d’une part les données phénotypiques (comment réagit l’organisme) et les données bibliographiques qui rassemblent tout ce qui précède.
-Il est clair que l’information pertinente ne peut être tirée de cet amas de données que si :
+Des méthodes, fondant des algorithmes rapides et efficaces et de telles méthodes doivent être conçues, améliorées et mises en œuvre sur la base d’analyses statistiques appropriées.
-  -on dispose d’ordinateurs puissants pour stocker et classer l’information ;
-  -on dispose de méthodes extrêmement performantes pour les traiter.
-On a donc besoin de méthodes, fondant des algorithmes rapides et efficaces et de telles méthodes doivent bien sûr être conçues, améliorées et mises en œuvre sur la base d’analyses statistiques appropriées.
-Notre équipe est par nature une équipe de Mathématiques. Elle est – jusqu’à présent – évaluée par la Commission 01 (Mathématiques) du CNRS et par le Conseil Scientifique du Département MIA (Mathématiques et Informatique Appliquées) de l’INRA. Son fonctionnement est donc celui d’une équipe de Mathématiques, dont le but premier est  dans des revues, si possible de haut niveau, en Mathématiques, et d’intervenir dans des congrès et des colloques.
+Notre équipe est par nature une équipe de Mathématiques. Son fonctionnement est donc celui d’une équipe de Mathématiques, dont le but premier est  dans des revues, si possible de haut niveau, en Mathématiques, et d’intervenir dans des congrès et des colloques.
 Mais c’est aussi une équipe que le CNRS a placée à l’interface avec la biologie. Comme toute équipe de Mathématiques Appliquées, elle a donc deux autres objectifs :
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-===== Invités 2014 =====
-  * [[http://halweb.uc3m.es/esp/Personal/personas/aarribas/esp/perso.html|Ana Arribas-Gil]], Universidad Carlos III, Madrid (2 semaines en janvier, 1 semaine en mai, 1 semaine en juin).
-===== Invités 2013 =====
+===== Master =====
-  * [[http://www.gobics.de/burkhard/|Burkhard Morgenstern]], Universität Göttingen, 6 mois d'oct. à mars 2014.
-  * [[http://etienne.roquain.free.fr/|Etienne Roquain]], Université Paris 6 (délégation CNRS, 6 mois)
-  * [[http://www.maths.lancs.ac.uk/~parkj1/|Juhyun Park]], Lancaster University (1 mois).
-===== Invités 2012 =====
+L'équipe est très impliquée (direction et cours) dans le [[https://formations.univ-evry.fr/plugins/evry/odf/_content/subprogram-data-science-sante-assurance-finance-fr-fr.pdf | Master Data Science Santé Assurance Finance]].
-  * [[http://bernd.strimmerlab.org/|Bernd Klaus]], Universität Leipzig (2 mois, Février à Mars).
-  * [[http://people.stat.sfu.ca/~dac5/Dave_Campbell/Dave_Campbell.html|Dave Campbell]], Université Simon Fraser (1 mois en juin).
-  *  Oksana Chkrebtii, Université Simon Fraser (7 au 21 juin).
-  * [[https://www.msu.edu/~hanada/|Kousuke Hanada]], Riken Plant Science Center, Japan (1 mois en juin).
-===== Invités 2011 =====
+Ce master 2 en alternance et en formation initiale propose une formation généraliste en statistique et apprentissage statistique, destinée aux étudiants en mathématiques appliquées et aux ingénieurs souhaitant se spécialiser en science des données.
-  * [[http://math.bu.edu/people/kolaczyk/|Eric Kolaczyk]], Boston University (3 mois à mi-temps avec l'ENSAE, du 15/09 au 15/12).
-===== Invités 2010 =====
+Grâce à des cours d'informatique (programmation et bases de données), les étudiants acquièrent les compétences indispensables en statistique et informatique pour devenir data scientists.
-  * [[http://www.dms.uaf.edu/~jrhodes/|John Rhodes]], Fairbanks University, Alaska (1 mois)
+Les évaluations, en grande partie sous forme de projets, développent la capacité à mettre en œuvre des méthodes et algorithmes, ainsi qu’à gérer des projets en équipe. La formation inclut également des cours spécialisés en santé, assurance et finance, offrant une expertise approfondie sur les données complexes de ces secteurs.
-  * [[http://www.dms.uaf.edu/~eallman/|Elizabeth Allman]], Fairbanks University, Alaska (1 mois)
+===== Séminaires =====
-  * [[http://halweb.uc3m.es/esp/Personal/personas/aarribas/esp/perso.html|Ana Arribas-Gil]], Universidad Carlos III, Madrid (3 semaines)
-  * [[https://www.msu.edu/~hanada/|Kousuke Hanada]], Riken Plant Science Center, Japan (1 semaine).
-  * [[http://www.maths.uq.edu.au/~gjm/|Geoff McLachlan]], University of Queensland, Brisbane Australia (1 semaine).
+  * [[http://www.math-evry.cnrs.fr/evenements/seminaire-statgen |Le séminaire principal de l'équipe Statistique et Génome]]
+  * [[https://mathforgenomics.github.io/ | Le séminaire interdisciplinaire (math. et génomique).]]
+  * [[http://www.math-evry.cnrs.fr/evenements/seminaire-statproba |Le séminaire Statistiques et probabilités]]
+===== Invités 2024 =====
+  * [[https://tdhock.github.io/ | Toby Hocking]], Tenured Associate Professor, Université de Sherbrooke, Département d’informatique.
 ===== Anciens membres =====

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